脉冲星搜寻软件presto安装教程

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一、update

非必须，建议进行

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$ sudo apt-get update

二、依赖包安装：

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sudo apt-get install python-pip python-tk vim git libfftw3-bin libfftw3-dbg libfftw3-dev libfftw3-doc libfftw3-double3 libfftw3-long3 libfftw3-quad3 libfftw3-single3 pgplot5 csh autoconf gfortran libglib2.0-dev libccfits-dev libcfitsio-dev:i386 libcfitsio-dev libx11-dev libpng-dev

如果出错需要一个一个安装查找哪个依赖与别的软件冲突。

三、创建文件夹

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$ cd ~
$ mkdir PRESTO
$ cd PRESTO

位置选择没有特殊要求，但是之后需要加入环境变量，最好避免路径中出现中文。

四、Git下载

进入刚刚建好的文件夹执行以下命令

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$ git clone git://github.com/scottransom/presto.git
$ git clone git://git.code.sf.net/p/tempo/tempo

五、tempo安装

这步需要注意，make的时候需要root权限。

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$ cd tempo
$./prepare
$./configure
$make && make install
$cp tempo.cfg src
$cp tempo.hlp src

六、设置环境变量

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$ sudo vi /etc/environment

末尾添加：

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PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/home/zhen/Developer/PRESTO/presto/bin:/usr/local/cuda-5.5/bin"

TEMPO="***/PRESTO/tempo/src"

PRESTO="***/PRESTO/presto"

PGPLOT_DIR=”/usr/lib/pgplot5”

FFTW_PATH=”/usr”

LD_LIBRARY_PATH=”/usr/local/cuda/lib64:/usr/local/cuda/lib:/***/PRESTO/presto/lib:/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyslalib/slalib.so”

PYTHONPATH=”/***/PRESTO/presto/python:/***/PRESTO/presto/lib/python”

其中，***是安装位置，需要按自己的位置替换
修改完毕后关闭所有终端，重新打开终端

七、安装presto

进入你想将presto安装在的文件夹后再执行以下命令：

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$ cd ***/PRESTO/presto/src
$ make makewisdom
$ make prep
$ make

make makewisdom(这步耗时较长)

八、测试

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$ cd ~/Downloads/presto/bin
$ wget http://www.cv.nrao.edu/~sransom/GBT_Lband_PSR.fil
$ readfile GBT_Lband_PSR.fil
$ rfifind -time 2.0 -o Lband GBT_Lband_PSR.fil
$ prepfold -n 64 -nsub 96 -p 0.004621638 -dm 62.0 GBT_Lband_PSR.fil

九、可能出现的错误

运行时报错：sh:’prepfold’ command not found:
问题描述：
运行命令ls *.dat | xargs -n 1 realfft（或者prepfold等）时出现报错：sh:realfft(或者prepfold) command not found:
问题原因：
bash和sh是终端的不同程序，安装方案中仅添加了.bashrc的环境变量。所以sh找不到命令。
解决方案：
1）添加全局环境变量，让sh也能识别找到程序
2）（推荐，方便后面加速）强行使用bash运行。
更改命令为：ls *.dat | xargs -n 1 > fftname.sh
然后gedit fftname.sh，里面每一行都是一个文件的名字。
在文件中，借助查找与替换：将每行文件名前添加realfft (后面有空格！，即realfft 233.dat)
保存并关闭，运行命令bash fftname.sh

最后放一张Parks脉冲星的图

参考：

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